学校创办于1934年，时名湖南国医专科学校，1960年改办为普通高等本科院校湖南中医学院，1990年原湖南科技大学成建制并入湖南中医学院，2002年湖南省中医药研究院与湖南中医学院合并，2006年经教育部批准更名为湖南中医药大学。2012年学校进入一本招生序列。目前学校与湖南省中医药研究院实行校院合一的管理体制。

学校现有含浦、东塘2个校区，总占地面积1000余亩，校舍建筑面积47万平方米。现有3所直属附属医院，12所非直属附属医院，5个校办合资企业。学校下设17个学院、16个研究中心（所）。学校现有学生总人数39532人，其中研究生1729人、全日制本科生17993人、专科生370人、成人学历教育学生19320人、留学生120人。学校图书馆藏书109.7万册，线装古籍2.5万余册。拥有教学科研仪器设备总值1.50亿元，有40万元以上的贵重仪器设备17台件、多媒体教室165间，建成了先进的校园网络和多媒体教学、教室监控、教学广播、会议视频、屏蔽系统。学校建设了一支结构合理、素质高、富有创新精神的师资队伍。现有在职教职工1759人，其中专任教师和实验室人员1066人；具有正高职称教师205人、副高职称教师277人；有博士生导师124人、硕士生导师446人。有国际a有突出贡献的中青年专家4人，卫生部有突出贡献的中青年专家2人，卫生部先进工作者1人，享受国务院政府特殊津贴的专家59人，享受省政府特殊津贴的专家2人，国际a“百千万人才工程”国际a级人选1人，国际a级杰出教师2人。湖南省“121人才工程”卓绝层次人选4人，湖南省高层次卫生人才“225”工程医学学科领军人才培养对象3人，医学学科带头人培养对象22人，省科技领军人才1人，省杰出专家1人，省杰出中青年专家12人，省级杰出教师4人，省级名医38人，省杰出教育工作者1人，省劳动模范先进工作者4人，省“百人计划”专家2人。湖南省普通高校教学名师2人，湖南省普通高校教学奉献奖2人。湖南省跨世纪学术和技术带头人培养对象及后备人选7人，省学科带头人培养对象17人。现有国际a级教学团队1个，省级教学团队4个。学校教学平台建设初具规模，为了更大程度上实现资源优化和资源共享，组建了医学基础、临床技能、药学基础、药学技能和综合信息5大教学实验中心，重点建设了具有特色优势、专业覆盖面广的医学、药学和信息类教学实验平台。其中国际a级实践教学示范中心1个，省级实践教学示范中心5个，国际a级大学生校外实践教育基地1个、省级大学生创新训练中心2个、省级校企合作人才培养示范基地3个。教学实验室面积5.7万平方米，各类教学实验室能开出实验项目570个。